Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX3O75364 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX3O75364 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX3O75364 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX3O75364 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX3O75364 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX3O75364 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX3O75364 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX3O75364 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX3O75364 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX3O75364 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX3O75364 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX3O75364 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX3O75364 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX3O75364 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX3O75364 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX3O75364 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX3O75364 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX3O75364 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX3O75364 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms