Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms