Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUBNO60494 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUBNO60494 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUBNO60494 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUBNO60494 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUBNO60494 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUBNO60494 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUBNO60494 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUBNO60494 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUBNO60494 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUBNO60494 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUBNO60494 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUBNO60494 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUBNO60494 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUBNO60494 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUBNO60494 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUBNO60494 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUBNO60494 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUBNO60494 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUBNO60494 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUBNO60494 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUBNO60494 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUBNO60494 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUBNO60494 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUBNO60494 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUBNO60494 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUBNO60494 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUBNO60494 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUBNO60494 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUBNO60494 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUBNO60494 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CUBNO60494 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUBNO60494 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUBNO60494 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUBNO60494 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUBNO60494 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms