Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALUO43852 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALUO43852 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALUO43852 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALUO43852 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALUO43852 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALUO43852 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALUO43852 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALUO43852 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALUO43852 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALUO43852 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALUO43852 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALUO43852 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALUO43852 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALUO43852 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALUO43852 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALUO43852 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALUO43852 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALUO43852 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALUO43852 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALUO43852 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CALUO43852 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALUO43852 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALUO43852 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALUO43852 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALUO43852 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALUO43852 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALUO43852 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALUO43852 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CALUO43852 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALUO43852 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALUO43852 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALUO43852 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALUO43852 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALUO43852 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALUO43852 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALUO43852 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CALUO43852 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALUO43852 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALUO43852 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALUO43852 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALUO43852 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALUO43852 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALUO43852 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALUO43852 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CALUO43852 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALUO43852 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALUO43852 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALUO43852 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALUO43852 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALUO43852 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALUO43852 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CALUO43852 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALUO43852 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALUO43852 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALUO43852 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALUO43852 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALUO43852 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms