Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
STRNO43815 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRNO43815 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRNO43815 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRNO43815 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRNO43815 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRNO43815 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRNO43815 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRNO43815 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRNO43815 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRNO43815 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRNO43815 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRNO43815 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRNO43815 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRNO43815 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STRNO43815 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRNO43815 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRNO43815 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRNO43815 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRNO43815 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRNO43815 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRNO43815 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRNO43815 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRNO43815 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRNO43815 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRNO43815 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRNO43815 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRNO43815 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRNO43815 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRNO43815 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRNO43815 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRNO43815 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRNO43815 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRNO43815 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRNO43815 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRNO43815 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRNO43815 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRNO43815 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRNO43815 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRNO43815 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRNO43815 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRNO43815 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRNO43815 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
STRNO43815 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRNO43815 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRNO43815 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRNO43815 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRNO43815 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRNO43815 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRNO43815 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRNO43815 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRNO43815 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRNO43815 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRNO43815 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STRNO43815 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STRNO43815 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRNO43815 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRNO43815 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRNO43815 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRNO43815 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRNO43815 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRNO43815 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRNO43815 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRNO43815 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRNO43815 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRNO43815 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRNO43815 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRNO43815 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRNO43815 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRNO43815 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STRNO43815 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRNO43815 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRNO43815 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRNO43815 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRNO43815 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRNO43815 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRNO43815 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRNO43815 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRNO43815 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRNO43815 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRNO43815 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRNO43815 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRNO43815 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRNO43815 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRNO43815 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRNO43815 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRNO43815 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRNO43815 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
STRNO43815 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRNO43815 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRNO43815 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRNO43815 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRNO43815 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRNO43815 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRNO43815 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRNO43815 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRNO43815 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRNO43815 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRNO43815 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRNO43815 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms