Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATCO43716 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATCO43716 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATCO43716 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATCO43716 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATCO43716 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATCO43716 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATCO43716 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATCO43716 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATCO43716 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATCO43716 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATCO43716 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATCO43716 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GATCO43716 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GATCO43716 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GATCO43716 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GATCO43716 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GATCO43716 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GATCO43716 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GATCO43716 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATCO43716 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATCO43716 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATCO43716 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATCO43716 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATCO43716 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATCO43716 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATCO43716 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATCO43716 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATCO43716 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATCO43716 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATCO43716 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATCO43716 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATCO43716 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATCO43716 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATCO43716 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms