Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTRA2O43464 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms