Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms