Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA2O43364 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms