Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX7O00628 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX7O00628 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms