Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PODXLO00592 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PODXLO00592 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PODXLO00592 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PODXLO00592 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PODXLO00592 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PODXLO00592 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PODXLO00592 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PODXLO00592 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PODXLO00592 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PODXLO00592 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PODXLO00592 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PODXLO00592 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PODXLO00592 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PODXLO00592 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PODXLO00592 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PODXLO00592 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PODXLO00592 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PODXLO00592 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PODXLO00592 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PODXLO00592 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PODXLO00592 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PODXLO00592 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PODXLO00592 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PODXLO00592 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PODXLO00592 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PODXLO00592 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PODXLO00592 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PODXLO00592 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PODXLO00592 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PODXLO00592 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PODXLO00592 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PODXLO00592 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PODXLO00592 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PODXLO00592 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PODXLO00592 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PODXLO00592 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PODXLO00592 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PODXLO00592 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PODXLO00592 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PODXLO00592 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PODXLO00592 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PODXLO00592 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PODXLO00592 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PODXLO00592 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PODXLO00592 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PODXLO00592 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PODXLO00592 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PODXLO00592 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PODXLO00592 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PODXLO00592 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PODXLO00592 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PODXLO00592 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PODXLO00592 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PODXLO00592 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PODXLO00592 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PODXLO00592 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PODXLO00592 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PODXLO00592 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PODXLO00592 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PODXLO00592 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PODXLO00592 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PODXLO00592 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PODXLO00592 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PODXLO00592 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PODXLO00592 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PODXLO00592 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PODXLO00592 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PODXLO00592 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PODXLO00592 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PODXLO00592 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PODXLO00592 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PODXLO00592 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PODXLO00592 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms