Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms