Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C6orf229H3BNL8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C6orf229H3BNL8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms