Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DIRC3C9JPN6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DIRC3C9JPN6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DIRC3C9JPN6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DIRC3C9JPN6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DIRC3C9JPN6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DIRC3C9JPN6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DIRC3C9JPN6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DIRC3C9JPN6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DIRC3C9JPN6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DIRC3C9JPN6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms