Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHLA1C9JL84 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms