Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN25C9JDP6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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