Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGTLC3B5MD39 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGTLC3B5MD39 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms