Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms