Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms