Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms