Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms