Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 586.4 ms