Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWB2

TRBV7-9, T-cell receptor beta variable 7-9 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV7-9A0A0J9YWB2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV7-9A0A0J9YWB2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV7-9A0A0J9YWB2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms