Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC138904.1-201ENST00000501520 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 TJAP1-215ENST00000612912 4312 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC002066.1-202ENST00000439070 699 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC005099.1-201ENST00000442083 610 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 TTN-AS1-215ENST00000585451 949 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 TTN-AS1-265ENST00000627661 806 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 TCF7L2-216ENST00000534894 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC096745.2-201ENST00000627783 1914 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 CD44-208ENST00000428726 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 MYO5A-205ENST00000399231 12225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 MYH1-201ENST00000226207 6024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 HNRNPA3-202ENST00000411529 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC087203.2-201ENST00000526502 1587 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 HSP90AB2P-201ENST00000507090 2176 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 ANKRD6-218ENST00000522441 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 DMBT1-202ENST00000338354 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 DMBT1-204ENST00000368909 7686 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 DMBT1-207ENST00000619379 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 UBN2-201ENST00000473989 14444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 TREML2-201ENST00000483722 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 DDX3X-217ENST00000629496 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 RPSAP72-201ENST00000407020 358 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 GRIK1-AS1-202ENST00000412579 818 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC009869.1-201ENST00000530418 528 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 CLEC4E-206ENST00000545274 730 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 GNG2-215ENST00000557376 573 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC119674.1-221ENST00000641594 1213 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 TTC33-201ENST00000337702 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 BTBD7-202ENST00000334746 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC073349.2-201ENST00000427545 1603 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 C8orf44-SGK3-201ENST00000519289 2949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 PKD1L3-201ENST00000620267 5199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC020658.3-201ENST00000568093 4028 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 COL11A1-201ENST00000353414 7173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 PCYT1A-201ENST00000292823 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 MCTP1-204ENST00000505078 2629 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 GK5-201ENST00000392993 9837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AL353052.2-201ENST00000441459 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 CPT1A-201ENST00000265641 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 CDH13-202ENST00000428848 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC005722.2-201ENST00000577087 3370 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 STXBP5L-208ENST00000497029 3036 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 THEM5-201ENST00000368817 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 LIN28AP2-201ENST00000445283 458 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 NEURL1-AS1-201ENST00000447820 439 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 LINC00954-202ENST00000449086 2995 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC104123.1-203ENST00000513158 575 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC087894.2-201ENST00000541797 462 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AL158151.4-201ENST00000600965 507 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC010538.1-201ENST00000615131 663 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 SCAF8-202ENST00000367186 4908 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 HPS4-203ENST00000402105 3562 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 CAPN3-206ENST00000397163 3228 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 ZNF567-204ENST00000588311 2042 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AP000941.1-201ENST00000530198 1388 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 DROSHA-202ENST00000442743 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 CEACAM6-201ENST00000199764 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 RXFP2-202ENST00000380314 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 SAMD8-201ENST00000372687 6935 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 SLC7A6-201ENST00000219343 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 NRIR-202ENST00000414795 506 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AL391095.1-201ENST00000422519 2004 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 LPAR1-205ENST00000541779 2490 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC109587.1-213ENST00000610844 652 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
POLR2AP24928 AC080112.3-201ENST00000612552 880 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms