Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 LINC01653-201ENST00000456026 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 MSL3-201ENST00000312196 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 MFAP3L-202ENST00000393702 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 TRHR-201ENST00000311762 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC096745.2-201ENST00000627783 1914 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 RNF139-AS1-201ENST00000499418 5654 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 PSMC1P3-201ENST00000453822 1318 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 PPFIA2-202ENST00000407050 3903 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 RIT2-201ENST00000326695 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AL138807.1-201ENST00000400354 459 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 RN7SKP261-201ENST00000410948 278 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 UQCRHP2-201ENST00000415651 288 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC019181.1-201ENST00000417151 310 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AL354732.1-204ENST00000421020 755 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 RPL5P6-201ENST00000425640 886 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 C5orf67-201ENST00000438651 765 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AL445686.1-201ENST00000443086 348 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AL356498.1-201ENST00000443334 334 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 OR2AI1P-201ENST00000448534 932 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 MYADML-203ENST00000491596 951 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 PPP4R2-207ENST00000495566 559 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC110800.1-201ENST00000505498 441 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 LINC01948-201ENST00000506836 656 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC024022.1-203ENST00000515392 478 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 LINC00678-201ENST00000527083 786 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC007751.2-201ENST00000534173 291 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC078886.1-201ENST00000549144 554 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AL132855.1-201ENST00000557368 207 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC092142.1-202ENST00000567021 829 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 TEX51-207ENST00000568484 731 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 RIT2-202ENST00000589109 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 RPL17P3-201ENST00000605695 525 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 OR10AE1P-201ENST00000606962 1029 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.120-201ENST00000614195 252 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC048380.3-201ENST00000623145 796 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 OR9Q1-201ENST00000335397 2488 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AL133279.3-201ENST00000563140 2352 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 CASR-201ENST00000490131 4015 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 C3orf30-201ENST00000295622 1814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 KIAA1324L-203ENST00000416314 3179 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 OR2G2-201ENST00000320065 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 FCAR-201ENST00000345937 608 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 IGBP1-AS1-201ENST00000366397 542 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 IL6-202ENST00000401630 765 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 RAET1K-201ENST00000403651 784 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC003080.1-201ENST00000413552 767 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 RPL7AP72-201ENST00000417266 768 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC114760.1-201ENST00000420310 652 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC073987.1-201ENST00000422683 638 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 CYP4F26P-202ENST00000433357 852 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC073475.1-201ENST00000434012 592 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 ARL17B-201ENST00000434041 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 ACTBP12-201ENST00000435871 418 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 ARL17A-203ENST00000445552 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AL024493.1-201ENST00000449217 833 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 LINC00572-201ENST00000450264 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 Z82173.1-201ENST00000453924 484 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC093010.2-201ENST00000481773 743 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 RN7SL403P-201ENST00000481783 305 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 BX293995.1-201ENST00000502880 755 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC123767.1-204ENST00000523523 273 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 OR2AL1P-201ENST00000529862 507 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 OR7E15P-201ENST00000533484 967 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 TMEM269-202ENST00000536543 983 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 MIR4314-201ENST00000583321 92 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms