Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 NMD3-201ENST00000351193 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SLC8A1-203ENST00000403092 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 NLRP14-201ENST00000299481 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 PLCE1-AS1-203ENST00000596633 1683 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 DHFR2-201ENST00000314636 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 VPS11-206ENST00000614944 3388 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 HRH4-201ENST00000256906 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 MECOM-208ENST00000468789 3691 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 DAPP1-201ENST00000296414 2955 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 RNA5SP78-201ENST00000364622 118 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SCNM1-201ENST00000368902 869 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 FTH1P3-201ENST00000394290 584 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 MAGEC3-202ENST00000409007 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 RN7SKP169-201ENST00000411124 291 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LYPLA2P3-201ENST00000417429 576 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC239727.1-201ENST00000431432 623 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC007237.1-201ENST00000442074 499 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LDHAP3-201ENST00000448312 1008 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC105393.1-202ENST00000449621 598 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LINC02037-201ENST00000455821 1195 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC020636.1-201ENST00000469268 565 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CSTA-202ENST00000479204 821 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC091951.4-201ENST00000512746 332 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 OR10J2P-201ENST00000514684 961 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ALG1L12P-201ENST00000515046 434 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC112192.1-201ENST00000515086 553 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 XAGE1B-205ENST00000518075 472 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC020688.1-201ENST00000519282 1248 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC104211.2-201ENST00000521317 436 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 OR4A19P-201ENST00000533579 1103 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ST3GAL3-237ENST00000533933 834 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC027013.1-201ENST00000554412 1057 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC009021.1-201ENST00000566098 375 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 C17orf80-208ENST00000582793 531 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC087289.3-203ENST00000587556 550 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ZNF793-AS1-205ENST00000589025 560 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC008991.1-201ENST00000591285 537 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC104794.4-201ENST00000607181 446 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC105339.4-201ENST00000624471 737 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ADD3-AS1-203ENST00000625954 472 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ASAH1-229ENST00000636537 1056 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 FBXW7-207ENST00000603841 2261 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SLC3A1-208ENST00000410056 1426 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ADGRE1-205ENST00000450315 2567 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 MARCH6-204ENST00000503788 2874 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CHD2-212ENST00000627622 1740 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 PRDM10-205ENST00000526082 3308 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL606490.2-201ENST00000457562 1330 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 WBP1L-201ENST00000369889 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL049842.1-201ENST00000402902 1479 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CPB1-208ENST00000491148 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 C9orf131-205ENST00000421362 3259 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ZNF200-201ENST00000396868 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ZNF708-201ENST00000356929 4004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 TCL6-207ENST00000483087 2194 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 HSPD1P5-201ENST00000511127 1720 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 VLDLR-AS1-201ENST00000416826 3167 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 PRYP4-201ENST00000306589 444 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ZNF254-201ENST00000339642 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 OR2T6-201ENST00000355728 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 RNA5SP141-201ENST00000364543 120 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CENPW-202ENST00000368326 443 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC084880.1-201ENST00000392530 545 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LYG1-202ENST00000409448 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC007359.1-201ENST00000417910 745 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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