Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC104083.1-201ENST00000569449 2615 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 HFE-207ENST00000357618 5286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 HMGCLL1-201ENST00000274901 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 TDG-202ENST00000392872 3251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 CNOT4-201ENST00000315544 3783 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 GTF2H1-210ENST00000530496 1700 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 POU6F2-210ENST00000559001 2403 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 LINC02210-213ENST00000591271 9678 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 MTF2-214ENST00000545708 4046 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 UCA1-201ENST00000397381 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AL590369.1-201ENST00000455074 470 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AP003032.2-201ENST00000533697 686 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 LINC00520-206ENST00000560336 883 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AP005210.1-201ENST00000583659 544 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC112187.3-201ENST00000607844 408 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 LINC01739-204ENST00000641712 1005 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 TENM2-203ENST00000518659 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 RBSN-201ENST00000253699 6678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 OGDH-206ENST00000447398 3474 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 MAGI2-214ENST00000628781 2013 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 OR2B11-203ENST00000641527 4545 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ARID1A-209ENST00000615191 3804 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AFF1-211ENST00000544085 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ARID1A-204ENST00000430799 6521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 DEPDC5-204ENST00000400246 5551 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 DCLRE1C-207ENST00000378255 2807 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 UBE2V1-202ENST00000371657 1973 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ZSCAN25-204ENST00000394152 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 GPATCH11-202ENST00000409774 3906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 FRMD7-201ENST00000298542 3198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 HINFP-201ENST00000350777 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 JAKMIP2-202ENST00000333010 2992 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 GCC2-201ENST00000309863 7537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AL136298.2-201ENST00000556497 1570 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AP001528.3-201ENST00000624364 3249 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 PARP1P1-201ENST00000413631 3026 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 COL12A1-207ENST00000483888 9637 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 MAPK10-361ENST00000641862 2462 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 DNAH10-209ENST00000614082 3484 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AMPD1-201ENST00000369538 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 SMCO2-203ENST00000535986 1096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 EGLN3P1-201ENST00000541727 720 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 RN7SL680P-201ENST00000620379 299 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 LINC02292-201ENST00000554522 1701 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 LINC01924-201ENST00000589376 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 LMOD1-201ENST00000367288 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 TIAM2-203ENST00000360366 5771 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 SLU7-201ENST00000297151 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ELF4-202ENST00000335997 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ALDH1L2-201ENST00000258494 7547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ZNF608-203ENST00000504926 4726 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ETS1-204ENST00000526145 3389 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AL049646.1-201ENST00000457009 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AP003469.4-201ENST00000565617 2825 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 NACAP1-201ENST00000419462 1555 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 CFAP61-210ENST00000451767 1946 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 SPATA31E2P-201ENST00000554414 4965 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 OPCML-207ENST00000541867 6277 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 OPCML-208ENST00000612177 6250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ADNP-206ENST00000621696 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 BRDT-203ENST00000370389 3696 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AL671986.1-201ENST00000422197 955 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 SUPT16H-204ENST00000555943 915 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC093334.1-201ENST00000559904 423 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC073389.2-201ENST00000606726 571 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AL008726.1-201ENST00000607703 569 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 MYH2-206ENST00000622564 2379 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 GPR161-210ENST00000546300 7388 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms