Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 GCNT2-216ENST00000495262 2214 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CDY4P-201ENST00000418290 1513 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 HPSE2-204ENST00000404542 3681 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 IL15-202ENST00000320650 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 MIR4458HG-203ENST00000606459 3239 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CHCHD7-207ENST00000518801 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 FLT1-203ENST00000540678 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SNX27-201ENST00000368838 1308 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC093768.1-201ENST00000505987 2173 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 DDAH1-202ENST00000426972 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AKT3-203ENST00000366539 5127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SLC24A1-211ENST00000544319 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC139256.1-201ENST00000569858 2598 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC016251.1-201ENST00000624299 4198 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC068044.1-201ENST00000441585 1978 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 PRICKLE2-AS3-201ENST00000473434 2496 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 PHF6-204ENST00000370803 4489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CCRL2-204ENST00000400882 1642 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CNPY1-204ENST00000636446 1637 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 TTC39A-212ENST00000447632 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 APH1B-201ENST00000261879 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 MTTP-208ENST00000511045 3154 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LINC00272-201ENST00000367563 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 NR1I3-206ENST00000367984 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 IGLV1-51-201ENST00000390290 389 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 FCAR-207ENST00000391725 830 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL035658.1-201ENST00000415054 357 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL450468.1-201ENST00000415166 450 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 BLNK-204ENST00000427367 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LINC01865-201ENST00000430529 845 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 S100A13-204ENST00000440685 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC145625.1-201ENST00000441444 592 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL441992.1-201ENST00000443631 544 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL606804.1-202ENST00000446347 481 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC110994.1-201ENST00000468519 406 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC016546.1-201ENST00000473590 463 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC027779.1-201ENST00000530492 516 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SETP16-201ENST00000531054 711 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC117503.2-201ENST00000538837 321 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 FLT1-205ENST00000543394 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 RPL41-204ENST00000546591 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 OR7E159P-201ENST00000553761 298 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC012186.1-201ENST00000566702 398 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC067796.1-201ENST00000586795 496 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL161725.1-211ENST00000592805 889 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LINC02018-202ENST00000608707 445 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 TRBV10-3-201ENST00000611462 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 GZMB-209ENST00000616551 559 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 FLT1-208ENST00000617835 434 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC008957.2-201ENST00000618632 396 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL136038.5-201ENST00000620835 554 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC007326.3-201ENST00000636418 176 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 HMGB4-203ENST00000519684 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 WISP3-204ENST00000368666 2700 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ZNF544-201ENST00000269829 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ASB8-205ENST00000536549 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AP003972.1-201ENST00000625192 5446 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SSX2B-204ENST00000616191 1344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LIMS1-203ENST00000393310 4392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 USP3-208ENST00000558285 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LRRC4C-202ENST00000527150 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 MIPOL1-211ENST00000556451 2282 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 MYO6-207ENST00000615563 4026 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ZNF19-210ENST00000567225 2838 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC073349.2-201ENST00000427545 1603 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CACNB2-201ENST00000282343 3524 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 DIS3L2-202ENST00000325385 3501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LL22NC03-63E9.3-201ENST00000407120 3111 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 DHX8-202ENST00000540306 3809 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CLDN12-201ENST00000287916 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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