Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 LINC00955-202ENST00000514422 1502 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 IL26-201ENST00000229134 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 PLA2G2C-201ENST00000247992 453 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 MBD3L1-201ENST00000305625 748 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 MAP1LC3C-201ENST00000357246 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 TSACC-202ENST00000368252 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 GPN2-201ENST00000374133 715 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 TIMD4-202ENST00000406964 581 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 SEPHS1P1-201ENST00000426891 958 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 SNAI1P1-201ENST00000428587 777 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC092098.1-201ENST00000429245 874 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 WWC3-AS1-201ENST00000430057 578 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC007683.1-201ENST00000432746 591 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AL513318.1-201ENST00000437925 991 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AL389885.1-201ENST00000447227 384 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 LINC00265-202ENST00000448955 468 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 MYB-AS1-201ENST00000455534 449 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC007731.3-201ENST00000458154 446 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 SLC17A1-203ENST00000468082 1242 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 RN7SL630P-201ENST00000483714 297 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 SEC22A-210ENST00000492595 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC114964.1-201ENST00000502306 1111 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC091982.1-201ENST00000518134 520 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 MRPS28-207ENST00000521434 585 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 RPL10P19-203ENST00000522289 663 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 IGKV2D-14-201ENST00000522473 355 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC104117.2-201ENST00000523735 515 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC108471.2-205ENST00000529314 628 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 MUCL1-202ENST00000546809 439 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC034102.1-201ENST00000552016 604 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC112484.4-201ENST00000567253 811 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 OR1X1P-201ENST00000606159 931 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 5_8S_rRNA.2-201ENST00000612732 151 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 THADA-205ENST00000404790 3043 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 OR9M1P-202ENST00000641564 3163 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 CYFIP2-221ENST00000618329 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 RCBTB1-201ENST00000258646 3816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 ERCC8-201ENST00000265038 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 MMADHC-202ENST00000422782 1462 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 COLGALT2-202ENST00000367520 2325 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 CDKL5-202ENST00000379996 3449 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 LINC01829-202ENST00000433133 2100 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 C8orf48-201ENST00000297324 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AHCYP5-201ENST00000331585 1238 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 FAM209B-201ENST00000371325 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AIF1-203ENST00000376059 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 RNA5SP203-201ENST00000410451 136 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AL390856.1-201ENST00000412174 628 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 RPL12P27-201ENST00000414870 496 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AL035658.1-201ENST00000415054 357 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 ARPP21-207ENST00000417925 3086 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 OR2L1P-201ENST00000422727 938 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 FKBP1AP3-201ENST00000423650 319 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC146944.2-202ENST00000425529 658 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 KCNQ5-AS1-201ENST00000429832 1101 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC005550.1-201ENST00000438923 312 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 LINC01713-201ENST00000445589 932 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AL603839.3-201ENST00000450713 605 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC006159.1-201ENST00000452009 386 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 RPS29P16-201ENST00000452798 171 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 RFC3P1-201ENST00000454568 682 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 RN7SL135P-201ENST00000490144 278 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 MYL5-205ENST00000505477 584 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC060765.1-202ENST00000518367 257 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC091939.1-201ENST00000522704 691 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC104031.1-201ENST00000527726 372 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 NTAN1P3-201ENST00000535885 715 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 FLVCR2-202ENST00000539311 1221 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 DDIT3-205ENST00000552740 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC007728.2-202ENST00000567728 1150 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 PRR13P4-201ENST00000577786 421 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC015818.5-201ENST00000578659 356 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC005758.1-201ENST00000586408 625 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PDK4Q16654 AC008751.1-201ENST00000600438 342 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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