Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms