Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms