Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms