Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms