Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW3

ABT1, Activator of basal transcription 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABT1Q9ULW3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ABT1Q9ULW3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABT1Q9ULW3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms