Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
INO80Q9ULG1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms