Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH7Q9ULB5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH7Q9ULB5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH7Q9ULB5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH7Q9ULB5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH7Q9ULB5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH7Q9ULB5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH7Q9ULB5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH7Q9ULB5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH7Q9ULB5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH7Q9ULB5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH7Q9ULB5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH7Q9ULB5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms