Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms