Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
FBXO4Q9UKT5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms