Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH22Q9UJ99 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDH22Q9UJ99 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDH22Q9UJ99 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms