Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNA1Q9UIW2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA1Q9UIW2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms