Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms