Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms