Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms