Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R1BQ9UD71 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R1BQ9UD71 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms