Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms