Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms