Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms