Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDE1Q9NZC3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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