Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKBH4Q9NXW9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKBH4Q9NXW9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKBH4Q9NXW9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKBH4Q9NXW9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKBH4Q9NXW9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKBH4Q9NXW9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKBH4Q9NXW9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKBH4Q9NXW9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKBH4Q9NXW9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKBH4Q9NXW9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKBH4Q9NXW9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKBH4Q9NXW9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms