Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRMT1Q9NXH9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms